COVID-19 au Sénégal: réflexion d´un microbiologiste

COVID-19 au Sénégal: réflexion d´un microbiologiste

COVID-19 in Senegal: reflection from a microbiologist

Assane Dieng^1,&, Jean Baptiste Niokhor Diouf², Serigne Mbaye Lo Ndiaye¹

¹Laboratoire de Bactériologie Virologie du Centre Hospitalier Universitaire le Dantec, Dakar, Sénégal, ²Service de Pédiatrie de l´Hôpital Roi Baudouin, Dakar, Sénégal

^&Auteur correspondant
Assane Dieng, Laboratoire de Bactériologie Virologie du Centre Hospitalier Universitaire le Dantec, Dakar, Sénégal

Opinion    

Depuis toujours et dans tous les pays du monde, les maladies infectieuses ont constitué l´une des premières causes de morbidité et de mortalité [1,2]. Aujourd´hui, grâce à la vaccination et les progrès de la médecine moderne, la mortalité de certaines maladies comme la variole, le tétanos, la poliomyélite, la fièvre jaune, la rougeole et la coqueluche a fortement diminué [3]. Cependant, certaines maladies respiratoires continuent de constituer un problème majeur de santé publique surtout dans les pays à ressources très limitées particulièrement en Afrique chez les enfants de moins de 5 ans, les personnes âgées ou vivant avec une maladie chronique [4,5]. En effet, les statistiques annuelles prouvent que ces infections respiratoires sont la cause de 1,9 millions de décès dans le monde dont 70% en Afrique et que les virus tels que ceux grippaux (influenza A, B, C) constituaient les principaux agents responsables [4-6]. L´incidence élevée du paludisme, de l´infection à VIH, des hépatites, des maladies rénales a fait que le fardeau des infections respiratoires en Afrique soit longtemps négligé [7]. En outre, il est établi que les virus respiratoires ne sont pas des virus pathogènes spécifiques et que bon nombre de personnes sont des porteurs asymptomatiques [8].Une étude réalisée au Sénégal avait montré que 42,1% des enfants de moins de 5 ans étaient porteurs asymptomatiques de tels virus [8].

Dans la prise en charge du COVID-19 au Sénégal, la stratégie de lutte pour endiguer l´épidémie consiste à détecter le matériel génétique du virus chez les personnes symptomatiques et asymptomatiques suspectes confinées. La charge virale de SARS CoV-2 n´est pas déterminée systématiquement. Dès lors plusieurs interrogations peuvent être posées. Les personnes déclarées malades de COVID-19 le sont-elles réellement? La recherche d´autres virus respiratoires tels qu´influenza virus ou virus respiratoire syncitial, adénovirus, rhinovirus etc. ne se révélerait-elle pas positive? Existe-t-il des arguments scientifiques plausibles démontrant l´imputabilité de ces maladies respiratoires au SARS CoV-2 uniquement et pas aux autres virus respiratoires? Au Sénégal depuis la confirmation du premier cas de COVID-19 à la date du 02 mars jusqu´au 14 avril 2020, un total de 299 patients ont été testés positifs avec seulement deux présentant une symptomatologie sévère. Parmi les 299 patients, il y´avait 183 qui étaient déclarés guéris dont un enfant de moins de deux ans et sur environ 20000 personnes qui étaient en contact étroit avec ces patients malades, les résultats d´analyse étaient négatifs. Ces résultats sur l´absence de cas sévère, le taux élevé de guérison et la négativité des tests chez les personnes de contact étroit avec les malades pourraient s´expliquer par un portage de coronavirus non viable ou à charge virale très faible (non détectable). En effet certains facteurs tels que le climat, les prédispositions génétiques pourraient jouer un rôle très important sur la viabilité de SARS CoV-2.

Pour le climat, au Sénégal l´apparition de l´épidémie a coïncidé avec la période de chaleur qui a une influence sur la viabilité des virus respiratoires [9]. Pour les facteurs de prédispositions génétiques, la négativité des tests chez les personnes contactes pourrait s´expliquer par la présence de facteurs génétiques prédisposants. Pour les malades présentant les symptômes respiratoires attribués à SARS CoV-2, les autres virus respiratoires tels qu´influenza virus, VRS, rhinovirus, entérovirus, métapneumovirus, para influenza virus et les coronavirus humains peuvent être responsables [8]. Ainsi la détection de SARS CoV-2 devrait être associée à la détection de ces virus respiratoires étant donné la ressemblance des signes cliniques que causent ces virus. Ainsi aucun argument solide n´est en faveur de l´imputabilité de ces maladies respiratoires au SARS CoV-2 d´autant qu´une étude antérieure réalisée à Dakar avait montré un portage des coronavirus humains de même que d´autres virus respiratoires chez les enfants de moins de 5 ans [8].

En conclusion, au Sénégal, le nombre de personnes supposées malades de COVID-19 est très faible. Ainsi, les efforts déployés contre le COVID-19 devraient être réorientés vers la prise en charge des autres pathologies prioritaires des sénégalais. Il y va de l´efficience dans la mise en œuvre des politiques de santé publique.

Conflits d'intérêts     

Les auteurs ne déclarent aucun conflit d'intérêts.

Contributions des auteurs     

Tous les auteurs ont lu et approuvé la version finale du manuscrit.

Références     

1. Global Health Estimates 2016. World Health Organization; Geneva: 2018. Deaths by cause, age, sex, by country and by region, 2000-2016.


2. Dye C. After 2015: infectious diseases in a new era of health and development. Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. 2014 May 12;369(1645):20130426. PubMed | Google Scholar


3. Greenlee C, Newton S. A review of traditional vaccine-preventable diseases and the potential impact on the otolaryngologist. Int Arch Otorhinolaryngol. 2018;22(3):317-329. PubMed | Google Scholar


4. World Health Organization. Acute respiratory infections in children. 2006.


5. Williams BG, Gouws E, Boschi PC, Bryce J, Dye C. Estimates of wide distribution of child deaths from acute respiratory infections. Lancet Infect Dis. 2002;2(1):25-32. PubMed | Google Scholar


6. Zar, HJ, Polack, FP. Childhood pneumonia: the role of viruses. Thorax. 2015 Sep;70(9):811-2. PubMed | Google Scholar


7. Yazdanbakhsh M, Kremsner PG. Influenza in Africa. PLoS Med. 2009 Dec;6(12):e1000182. PubMed | Google Scholar


8. Rebecca B Knobbe, Abdallah Diallo, Amary Fall, Aida D Gueye, Assane Dieng, Tabitha D van Immerzeel et al. Pathogens Causing Respiratory Tract Infections in Children Less Than 5 Years of Age in Senegal. Microbiol Insights. 2019;12:1178636119890885. PubMed | Google Scholar


9. Ibramima Socé-Fall. Influenza Surveillance In the WHO African Region. Accessed on Mar. 24, 2020.