Aspects épidémiologiques et bactériologiques des infections du site opératoire (ISO) dans les services de chirurgie à l’Hôpital National de Niamey (HNN)

Aspects épidémiologiques et bactériologiques des infections du site opératoire (ISO) dans les services de chirurgie à l’Hôpital National de Niamey (HNN)

Epidemiological and bacteriological features of surgical site infections (ISO) in the Division of Surgery at the Niamey National Hospital (HNN)

Ousmane Abdoulaye^1,&, Mahaman Laouali Harouna Amadou², Oumarou Amadou², Ousseini Adakal³, Harouna Magagi Larwanou⁴, Laouali Boubou⁴, Djimraou Oumarou⁴, Moussa Abdoulaye⁴, Saidou Mamadou⁵

 

¹Faculté de Sciences de la Santé, Université Dan Dicko Dan Koulodo de Maradi, Service de Biologie, Centre Hospitalier Régional de Maradi, Niger, ²Faculté de Sciences de la Santé, Université Dan DickoDanKoulodo de Maradi, Service des Maladies Infectieuses, Centre Hospitalier Régional de Maradi, Niger, ³Faculté de Sciences de la Santé, Université Dan DickoDanKoulodo de Maradi, Service de Chirurgie, Centre Hospitalier Régional de Maradi, Niger, ⁴Service de Biologie, Hôpital National de Niamey, Niger, ⁵Faculté de Sciences de la Santé, Laboratoire de Bactériologie Virologie, Université Abdou Moumouni de Niamey, Niger

 

 

^&Auteur correspondant
Abdoulaye Ousmane, Université Dan Dicko Dan Koulodo, Maradi, Service de Biologie, Centre Hospitalier Régional de Maradi, Niger

 

 

 

 

Les infections du site opératoire (ISO) incluent toute infection sur le site opéré, survenant dans les 30 jours suivant l'intervention ou dans l'année s'il y a eu mise en place d'un implant ou d'une prothèse [1]. Ils constituent un véritable problème de santé publique en Afrique avec une incidence qui varie de 6,8% à 26% [2-4]. Au Niger, peu d'études ont été réalisées sur la fréquence des ISO. Afin de mieux cerner le problème, réduire les dépenses en santé, éviter l'émergence des bactéries multi-résistantes, il est nécessaire de recourir à une surveillance épidémiologique. C'est pourquoi nous nous sommes fixés comme objectifs d'étudier les aspects épidémiologiques des souches bactériennes isolées au cours des ISO et d'évaluer leur profil de résistance aux antibiotiques à l'Hôpital National de Niamey.

 

 

Il s'agissait d'une étude rétrospective, analytique et descriptive réalisée dans les différents services de chirurgie de l'Hôpital National de Niamey. La population d'étude était constituée de patients opérés et hospitalisés au moins 72 heures dans les services de chirurgie du 1er janvier 2015 au 31 Décembre 2016 présentant des suspicions d'ISO. Chez chaque patient, un prélèvement de pus a été effectué par écouvillonnage ou par ponction à l'aide d'une seringue stérile à usage unique. Ces prélèvements ont été acheminés au laboratoire pour leur exploitation en respectant les bonnes pratiques de laboratoire. Les échantillons obtenus étaient traités selon la procédure en vigueur dans le laboratoire. L'examen macroscopique a permis de noter la couleur, la consistance et l'odeur. L'examen microscopique a permis de réaliser une étude cytologique quantitative et qualitative après coloration au May GreenwaldGiemsa et d'apprécier les bactéries au GRAM positif ou négatif. La mise en culture a été réalisée sur gélose chocolat (GC) + Polyvitex incubée sous cloche. L'identification des microorganismes isolés a été réalisée par les méthodes de bactériologie classique (morphologie et mobilité à l'état frais, coloration de Gram, recherche d'une oxydase, d'une catalase ainsi que les autres caractères biochimiques). L'étude de la sensibilité aux antibiotiques a été réalisée par la méthode de diffusion en gélose. Ainsi, les variables étudiées sont les suivantes: âge, sexe, type de prélèvement, germes identifiés, antibiotiques testés. Tous les patients ayant des dossiers incomplets ont été exclus de cette étude.

 

 

Du 1er Janvier 2015 au 31 Décembre 2016, 167 prélèvements provenant des services chirurgicaux ont été reçus et analysés au laboratoire de bactériologie de l'HNN pour suspicions d'ISO. Durant cette période 6740 patients ont été opérés soit une incidence de 2,47%. La population d'étude était constituée de 128 hommes (76,66%) et 39 femmes (23,24%) soit une sex-ratio de 3,3. L'âge moyen était de 31,16 ans avec des extrêmes de 20 mois et 80 ans. L'analyse des 167 prélèvements a donné lieu à 118 cultures positives avec 110 cultures monomicrobiennes et 8 cultures polymicrobiennes à 2 germes, soit un total de 126 souches bactériennes isolées. Au total, 10 genres bactériens ont été identifiés avec 13 espèces (Tableau 1). Les germes identifiés en fonction des services de chirurgie, sont représentés dans le Tableau 2. Le taux de résistance des bactéries Gram négatif et Gram positif est résumé dans le Tableau 3.

 

 

La contamination du site opératoire survient le plus souvent au cours de la période opératoire, soit à partir de la flore du patient présent avant l'incision, soit à partir de la flore du personnel, soit à partir des solutions antiseptiques ou d'instruments contaminés [3]. En dépit des progrès réalisés dans le domaine de la chirurgie (niveau d'asepsie, connaissance parfaite des ISO, antibioprophylaxie adaptée), les ISO restent une cause majeure de morbi-mortalité post-opératoire. Ces infections touchent 0,76 % des patients en France [5], 16% au Maroc [6]. Dans les pays en voies de développement comme le Niger, la prévalence des ISO représentent respectivement 7,3% au Bénin [7], 11% au Togo [4], 18% en République Centrafricaine [8] et 23,35% au Burkina Faso [9]. Selon une méta-analyse en Afrique sub-saharienne, l'incidence des ISO variaient de 6,8% à 26% avec une prédominance en chirurgie générale [2]. La survenue des ISO dépend du type de chirurgie mais également du niveau de contamination du site opératoire. Dans notre étude, beaucoup plus de germes étaient retrouvés en chirurgie digestive (78,5 %) que dans les autres services chirurgicaux. Dans notre étude, l'âge moyen des patients atteints d'ISO est de 31,16 avec une prédominance masculine. Kanassoua retrouvait la même prédominance masculine sur une tranche d'âge de 19-30 ans [4]. Au Maroc, Kaabachi avait rapporté une prédominance masculine dans son étude sur l'incidence des ISO en chirurgie orthopédique pédiatrique [10]. Les ISO ont une étiologie bactérienne. La recherche des germes responsables a donné lieu à 118 cultures positives soit 71% avec 110 cultures monomicrobiennes et 8 cultures polymicrobiennes à 2 germes. Au total de 126 souches bactériennes ont été isolées. Ces résultats sont inférieurs à ceux trouvés par Ouédraogo en 2011 avec 84,8% au Burkina Faso [9].

 

En Côte D'Ivoire, Faye-Kette H a rapporté un rendement similaire de 70% de culture positive [3]. Cela confirme bien que la culture demeure plus sensible que la microscopie dans le diagnostic biologique des ISO, surtout dans les prélèvements des pus. A l'issue de notre étude, l'espèce S.aureus était largement majoritaire (31%) suivie de E.coli (23%) et de Pseudomonas aeruginosa (9,5%). Cette distribution était similaire de celle rapportée dans des études menées dans plusieurs pays d'Afrique [4, 11-13]. Par contre, plusieurs auteurs ont rapporté une distribution différente. C'est ainsi qu'en Côte d'Ivoire, Faye-Kette H avaient rapporté une nette prédominance de Pseudomonas aeruginosa [3] alors qu'à Madagascar, une étude rapportait une fréquence d'Acinetobacterbamannii de 26,6% par Randriambololona VH et al en 2007 [14]. Ces différences s'expliqueraient par le fait que ces germes sont responsables d'hospitalisme infectieux ou infections nosocomiales [15]. L'étude du profil de sensibilité aux antibiotiques a montré que la plupart des bactéries isolées étaient résistantes aux antibiotiques couramment utilisés. Les souches de S.aureus ont montré des résistances aux bétalactamines. Par contre les aminosides et la vancomycine gardent une certaine efficacité. Les souches d'entérobactéries dans leur majorité présentaient des taux de résistance très élevés aux bétalactamines. Cependant, elles étaient restées sensibles dans une moindre mesure aux fluoroquinolones et aux aminosides. L'imipenème était efficace sur tous les isolats testés. Dans notre étude, les souches d'Escherichia coli étaient sensibles à 100% à l'imipenème. Des résultats similaires étaient observés dans une étude menée au Congoen 2014 [1]. Au Bénin, Hodonou a rapporté en 2016 des résistances de 100% à l'acide-clavulanique des souches d'E coli isolées dans les ISO [7]. En Côte d'Ivoire, Faye-Kette avait rapporté des résultats inferieurs avec 40% de résistance de E coli aux inhibiteurs de bétalactamines (l'acide-clavulanique) [3]. Dans notre série, les souches d'E.coli présentaient des résistances aux fluoroquinolones et aux aminosides. Des résultats comparables étaient rapportés par les études de Ouédraogo au Burkina Faso [9].

 

Dans notre étude, les souches de Klebsiella pneumoniae étaient sensibles 100% à l'imipenème et à la norfloxacine. Elles étaient résistantes de 75 à 100% aux les bétalactamines. Ces résultats étaient semblables à ceux retrouvés dans des études réalisées au Bénin et en Côte d'Ivoire [3, 7]. Dans notre étude, les souches de Proteus mirabilis présentaient des résistances aux betalactamines testés (100% à l'Amoxicilline, l'Acide-clavulanique, la ticarcilline, la cefoxitine, la cefalotine et la Céfépime), (50% à la ceftriaxone et la ceftazidine). Ceci est identique aux résultats rapportés par Hodonouménée au Bénin en 2016 [7]. Dans notre étude, les souches de S.aureus avaient montré des résistances de 37% et 57% respectivement à la vancomycine et teicoplanine. Ces résultats sont comparables à ceux rapportés par Ouédraogo au Burkina Faso en 2011 [9]. Aussi, la plupart des souches de S.aureus avaient montré des résistances de 88,6% à la Pénicilline G, 83% à l'oxacilline. Des résultats proches aux nôtres ont été observés au Burkina Faso et en Côte d'Ivoire [3, 9]. Ces variations de résistance des différentes souches bactériennes isolées vis-à-vis des antibiotiques pourraient s'expliquer par l'absence de stratégies de prescription des antibiotiques, l'automédication, l'ignorance des problèmes de résistance aux antibiotiques sont des causes directes de l'inactivité des bétalactamines aux souches bactériennes isolées. Globalement il était difficile de comparer avec certitude ces résultats à ceux d'autres auteurs vu les différences constatées en rapport avec le choix de molécules testés, l'état pathologique des malades, la pathologie opérée et la flore microbienne de l'hôpital ou du service concerné.

 

 

Les infections du site opératoire (ISO) restent des complications fréquentes de la chirurgie. Il convient de prendre des mesures d'antibioprophylaxies afin de limiter leur survenue.

 

 

Les auteurs ne déclarent aucun conflit d'intérêts.

 

 

Tous les auteurs ont lu et approuvé la version finale du manuscrit.

 

 

Tableau 1: répartition des échantillons selon les germes identifiés

Tableau 2: germes identifiés en fonction des services de chirurgie

Tableau 3: profil de sensibilité des bactéries isolées aux antibiotiques

 

 

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