Sensibilité aux antibiotiques des souches de staphylococcus aureus communautaires dans la région de Nouakchott (Mauritanie)

Sensibilité aux antibiotiques des souches de staphylococcus aureus communautaires dans la région de Nouakchott (Mauritanie)

Antibiotic susceptibility of community-acquired strains of staphylococcus aureus in Nouakchott Region (Mauritania)

Mohamed Lemine Ould Salem^1,2,& , Sidi Mohamed Ghaber^1,2, Sidi El Wafi Ould Baba^2,3, Mohamed Mahmoud Ould Maouloud¹

 

¹Service des Laboratoires, Centre Hospitalier National de Nouakchott, Mauritanie, ²Faculté de Médecine de Nouakchott, Mauritanie, ³Service de Médecine Interne, Centre Hospitalier National de Nouakchott, Mauritanie

 

 

^&Auteur correspondant
Mohamed Lemine Ould Salem, Service des Laboratoires, Centre Hospitalier National de Nouakchott, Mauritanie

 

 

 

 

Staphylococus aureus (S. aureus), décrit pour la première fois par Ogston il y'a plus de cent ans, reste un pathogène majeur de l'homme, causant des infections de la peau et des tissus mous, des septicémies, des pneumonies, des endocardites et des abcès profonds [1,2]. C'est également le germe le plus isolé dans les infections des plaies par des corps étrangers [1] et est responsable également de toxi-infections alimentaires [2]. Cette bactérie est devenue de plus en plus résistante aux antibiotiques; en effet, la résistance à la Pénicilline a rapidement atteint les 90% des souches. C'est au début des années 1960 que les premières souches de S. aureus résistantes à la méticilline (SARM) sont apparues après introduction de la méticilline, première bêta-lactamine résistantes aux pénicillinases [1]. La résistance à la méticilline est liée à l'acquisition d'une autre protéine liant la pénicilline, la PLP2a ou PLP2', présentant peu d'affinité pour les béta-lactamines. La production de PLP2a est codée par le gène chromosomique mec A dont l'origine reste encore inconnue [3]. La fréquence des SARM est variable dans le monde, faible en France et importante aux USA atteignant jusqu'à 72% dans les infections cutanées [4]. L'objectif de ce travail est d'évaluer la sensibilité des souches communautaires de S. aureus isolées à partir de différents produits pathologiques vis-à-vis des principaux antibiotiques utilisés dans le traitement des infections dues à ce germe, dans la région de Nouakchott en Mauritanie.

 

 

Souches étudiées: il s'agit d'une étude rétrospective qui a été réalisée sur l'ensemble des souches de Staphylococus aureus isolés entre Janvier 2014 et Août 2015 au laboratoire du Centre Hospitalier National et au deux laboratoires privés de la ville de Nouakchott, dans différents produits pathologiques (Tableau 1). Il s'agit au total de 281 souches dont l'identification a été faite selon les critères classiques : morphologie des colonies, coloration de Gram, recherche de la catalase et de la coagulase et fermentation du mannitol.

 

Sensibilité aux antibiotiques: la sensibilité aux antibiotiques a été déterminée par la méthode de diffusion de disques en milieu gélosé de Muller/Hinton, selon les recommandations du CA-SFM (comité de l'antibiogramme de la société française de Microbiologie [5]. Les antibiotiques étudiés sont : pénicilline G (P-6µg), oxacilline (OXA-5mg), fosfomycine (FOS-5mg), érythromycine (E-15UI), chloramphénicol (C-30mg), lincomycine (L-15mg), gentamicine (GM-15mg), spiramycine (SP-100mg), ofloxacine (OFX-5mg), ciprofloxacine (CIP-5mg), amikacine (AN-30UI), vancomycine (VA-30mg) et cefoxitine (FOX-30mg), La recherche de la résistance à la méticilline a été effectuée par la méthode de diffusion, d'une part du disque de céfoxitine 30 µg où un diamètre d'inhibition autour du disque de moins de 27 mm et la présence de colonies dans la zone d'inhibition témoignent de la présence d'un SARM, et d'autre part, par le disque d'oxacilline 5 mg où la présence d'une souche ayant un diamètre < 20 mm est considérée comme SARM.

 

 

Cette étude concernait les souches de S aureus isolées à partir de 281 produits pathologiques, dont les suppurations cutanées étaient majoritaires représentant ainsi 62.6% (157/281) des produits pathologiques, suivies des suppurations d’otites moyennes chroniques : 12.4% (35/281), des ECBU : 10% (28/281), des spermocultures : 8.9% (25/281) et des liquides articulaires : 4.2% (12/281). La bactérie a été également isolée dans d’autres produits pathologiques tels que le liquide pleural, l’écouvillonnage nasal et le prélèvement urétral. La répartition des souches de S aureus, selon les différents produits pathologiques est représentée dans le Tableau 1.

 

Concernant les résultats de la résistance aux antibiotiques des souches de S aureus, ne sont rapportés que ceux concernant les souches isolées des produits pathologiques où le nombre était significatif (les suppurations cutanées, les suppurations d’otites moyennes chroniques, les ECBU, les spermocultures, et les liquides articulaires). L’antibiotique présentant la plus faible activité sur les souches isolées à partir des différents produits pathologiques était la pénicilline (96 à 100% de résistance), suivi du cotrimoxazol (66 à 75% de résistance). La vancomycine et l’amikacine étaient, en revanche, actives sur l’ensemble des souches isolées. La fréquence de résistance aux antibiotiques étudiés des différentes souches isolées selon l'origine de l'infection est représentée sans le Tableau 2.

 

 

Le taux de souches sauvages dans notre série était faible environ 3%. Elazhari et al. [1] décrivent au Maroc, un taux comparable d'environ 4%. La résistance à la pénicilline G dans notre série est importante dépassant celle décrite par plusieurs auteurs [1, 6,7]. Le phénotype Pénicilline G isolé était présent en moyenne de 37% dans les suppurations. Le taux de SARM communautaires qui était entre 25% et 26% dans les suppurations, de 34,3% dans les ECBU et de 28% dans les spermocultures est plus élevé que celui décrit par El azhari et al. [1] qui rapportent un taux seulement de 7,1% à Casablanca et de celui décrit par El hamzaoui [8] et al. (7 souches sur 61, soit 11,4%) chez les patients externes. Ce taux important des SARM communautaires pourrait être expliqué par l'usage anarchique de l'oxacilline dans notre pays. La résistance aux Macrolides-Lincosamyne-Streptogramines (MLS) donnant le phénotype MLSb inductible, était retrouvée dans 6% des souches urinaires et 27% des souches isolées à partir des suppurations. Ces taux importants de résistance pourraient s'expliquer eux aussi par l'usage inapproprié de l'érythromycine.

 

Le phénotype MLSb constitutif représentait 2% au sein des isolats urinaires et environ 3% dans les suppurations. Les fluoroquinolones gardent une bonne activité sur les souches de pus. En revanche, un taux non négligeable de résistance à été constaté avec les souches isolées des ECBU dont l'usage de ces molécules en antibiothérapie probabiliste des infections urinaires pourrait en être la cause. L'activité des aminosides est variable, l'amikacine était active sur toutes les souches (cette molécule n'est pas commercialisée en Mauritanie) alors que la résistance à la gentamicine est de d'ordre de 10% et souvent associée au phénotype SARM. Le cotrimoxazol est quasi inactif (77% de résistance). Aucune résistance à la vancomycine n'a été retrouvée.

 

 

L'activité de la Pénicilline G sur les souches de S. aureus isolées dans la région de Nouakchott est quasi nulle et le taux de SARM communautaire est important atteignant jusqu'à 34%. Ceci pourrait être expliqué par l'usage anarchique de ces molécules ce phénomène doit inciter les autorités sanitaires du pays à envisager une stratégie efficace concernant l'approvisionnement et les règles de prescription des ces molécules. Notons que la spiramycine et la lincomycine gardent une bonne activité sur les souches se s aureus et pourraient constituer par conséquent une alternative pour le traitement de ces infections.

 

 

Les auteurs ne déclarent aucun conflits d’'intérêts.

 

 

Tous les auteurs ont lu et approuvé la version finale du manuscrit.

 

 

Tableau 1: nombre de souche par type de prélèvement

Tableau 2: fréquence de résistance aux antibiotiques par produit pathologique

 

 

1. Elazhari M. Activité de 16 Antibiotiques vis-à-vis des Staphylococcus aureus communautaires à Casablanca (Maroc) et prévalence des souches résistantes à la méthicilline. Eur Sci Res. 2009;30(1):128-37. PubMed | Google Scholar


2. Lagier JC, Letranchant L, Selton-Suty C, Nloga J, Aissa N, Alauzet C et al. Bactériémies et endocardites à Staphylococcus aureus. Ann Cardiol Angeiol. 2008;57:71-7. PubMed | Google Scholar


3. Hameg S, May-Michelangeli L, Le Turdu F. Apport du kit Servitex Staphylocoque MRSA^® dans le diagnostic rapide des souches de Staphylococcus aureus résistantes à la méticilline. Med Mal Infect. 2002;32:107-14. PubMed | Google Scholar


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8. Elhamzaoui S, Benouda A, Allali F, Abouqual R, Elouennass M. Sensibilité aux antibiotiques des souches de Staphylocoques aureus isolées dans deux hôpitaux universitaires à Rabat, Maroc. Med Mal Infect. 2009;39(12) : 891-5. PubMed | Google Scholar